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科研進展

武漢病毒所袁志明/夏菡團隊在全球蟲媒與特異性病毒序列、多樣性、生物安全風險綜合數(shù)據(jù)集方面取得新進展

發(fā)表日期:2023-05-22來源:武漢病毒研究所放大 縮小

      吸血節(jié)肢動物中傳播循環(huán)的病毒有兩大類:蟲媒病毒(arbovirus)和節(jié)肢動物特異性病毒(arthropod-specific virus, ASV)。蟲媒病毒能在脊椎動物和節(jié)肢動物中復制,對人類或動物具有致病性,給全球公共衛(wèi)生來沉重負擔。節(jié)肢動物特異性病毒僅在節(jié)肢動物中復制,它們可能是蟲化病毒進化的起源。然而,目前沒有涵蓋所有已知蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒種類、生物安全風險等級、基因組節(jié)段、地理分布等信息的綜合數(shù)據(jù)集。

      2023年5月19日,國際學術期刊Scientific Data在線發(fā)表了武漢病毒所/生物安全大科學中心袁志明/夏菡團隊在蟲媒病毒生態(tài)健康和生物安全領域的最新研究論文,文章題為“A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus”(全球蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風險綜合數(shù)據(jù)集)。研究人員通過整合美國CDC蟲媒病毒名錄(Arbovirus Catalog)、第六版《微生物和生物醫(yī)學實驗室生物安全》(BMBL 6th)附錄VIII-F、國際病毒分類委員會(ICTV)的病毒分類信息以及Genbank序列等有關信息,提取分類學、生物安全風險、基因節(jié)段、核酸和氨基酸序列、地理分布等,構建了首個全球蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的綜合數(shù)據(jù)集。

      該數(shù)據(jù)集包含了(1)615個蟲媒病毒(460個病毒種),98,994條記錄和190個節(jié)肢動物特異病毒(180個病毒種),2,100條記錄,共包括34個病毒科,89個病毒屬和640個病毒種(圖1a)。本研究詳細展示了蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒間的基因組節(jié)段差異(圖1b)、生物安全風險建議等級(圖1c)、病毒及其節(jié)肢動物媒介的全球分布、宿主來源等特征(圖1d)。為深入理解蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的相互作用、進化規(guī)律和風險評估提供了豐富的數(shù)據(jù)資源(圖2)。

      武漢病毒所博士后黃英、博士研究生汪順龍和山東理工大學副教授劉紅為論文共同第一作者,武漢病毒所夏菡青年研究員和浙大城市學院明朝燕副教授為論文共同通訊作者,武漢病毒所袁志明研究員、美國德州大學醫(yī)學分部Sergio Rodriguez助理教授為該項研究的合作作者。該研究得到國家重點研發(fā)計劃項目、國家自然科學基金項目和中科院中非中心項目等項目的資助。

 

圖1. 蟲媒病毒和節(jié)肢動物特異病毒的分類、基因組節(jié)段和生物安全分級建議和宿主來源 

 

 

 

圖2. figshare數(shù)據(jù)集部分信息 

 

文章鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41597-023-02226-8

數(shù)據(jù)鏈接:

https://figshare.com/articles/dataset/A_global_dataset_of_viral_sequence_diversity_and_distribution_of_arboviruses_and_arthropod-specific_viruses/22154573?file=40281991

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